|
Titel
8
|
4. Genteknologi, mikrobiologi og SOC/SRC
Idet vi fortsætter at arbejdem med bakterier starter vi ud med at se på, hvordan bakterier naturligt udveksler DNA mellem individer og populationer.
Vi fortsætter med illustrere hvordan DNA-bioteknologi kan anvendes at tilføre en organisme nye egenskaber.
I forbindelse med øvelsen får vi også indsigt i reguleringen af gen-ekspression på transkriptions nivau, når vi ser på en regulering af transskriptionen af gener foran lac-operonen.
Under vejs stifter vi også bekendtskab med stamceller og kloning af celler eksemplificeret med fåret Dolly der blev skab ud fra cellekerne fra en brystepitelcelle fra moderen til Dolly.
En oversigt over CRISPR teknikken giver os kendskab til en af de nyeste værktøjer til, at lukke og slette gener.
Vi kommer ind på:
Bakteriens opbygning og indretning repeteres
Vi arbejder med resistens i mikroorganismer
Antibiotika og resistenmekanismer, Hæmmere af transkription, translation, stoftransport, enzymer i stofskiftet
Indsigt i CRISPR-teknikken og dens potentielle anvendelser
Celle kloning
Ligaser
Restriktions enzymer, DNA endo-nukleaser:
Transformation
Transfektion
Transduktion
Konjugation (Sexduktion)
Varme-chock
PCR repetetion
DNA-sekventering (Kun berørt)
Kvantifisering af bakterier og andre mikroorganismer (tælling og optisk densitetsmåling OD)
Øvelse Vækstforsøg med gær og E.coli (SRC)
Eksponentiel vækst N(t) = No exp((ln2/Td)t)
Logistisk vækst N(t) = (a/b)/(1+c*exp(-bt))
Øvelse transformation af det Green flourescent Protein-gen (gfp-gen) bærende plasmid pGLO
Kernestof:
Genteknologi
Biologibogen, Systime, bioteknologi kapitlet: https://biologibogen.systime.dk/?id=546¨
Bioteknologi, HTX, Systime, Bakterier, plasmider og transformation: https://bioteknologi.systime.dk/?id=350
Bioteknologi, HTX, Systime, Cloning, bakteriofager af DNA: https://bioteknologi.systime.dk/?id=382
Bioteknologi, HTX, Systime PCR: https://bioteknologi.systime.dk/?id=441
Bioteknologi, HTX, Systime, Genregulering hos prokayoter: https://bioteknologi.systime.dk/?id=374#c1099
Øvelsesvejledninng på engelsk , EDVOTEK: https://www.edvotek.com/site/pdf/222.pdf
Øvelsesvejledning på dansk: https://www.lectio.dk/lectio/519/lc/64362723058/res/64362723059/778222_AA.pdf
Journalopsamling vækstforsøg SRC: https://ktsdk.sharepoint.com/:w:/s/Section_168849/EQT2FRQHaalAqAYXek22FlUB_FDXLNO8W2Ce5B7p2NJSSw?e=McRiKr
LAc-operon video : https://www.youtube.com/watch?v=sc9pAk0blgo&t=4s
Rapporthjælp bl.a. om gener og funktionelle sekvenser på plasmider : https://www.lectio.dk/lectio/519/aktivitet/aktivitetforside2.aspx?absid=63268148824&prevurl=SkemaNy.aspx%3fweek%3d032024&laererid=48433872182
CRISPR-teknikken:¨
Janifer Doudnas to præsentationer TED Talk
CRISPR: Gene editing and beyond: https://www.youtube.com/watch?v=4YKFw2KZA5o
How CRISPR lets us edit our DNA: https://www.ted.com/talks/jennifer_doudna_how_crispr_lets_us_edit_our_dna/transcript
CRISPR: Værktøj mod sygdom - Blad nr. 5-2022, Aktuel Naturvidenskab: https://aktuelnaturvidenskab.dk/find-artikel/nyeste-numre/5-2022/crispr
CRISPR In vivo, Brilliance, Gene Editing Inside the Body Using CRISPR: https://www.youtube.com/watch?v=EPTeaXMVcyY (6 min)
Cellekloning
Dollyfilm om Forskerne, dyrene, teknikken og samfundspolitikken
The History of Cloning, Learn Genetics, Genetic Science learning Center University of Utah: https://learn.genetics.utah.edu/content/cloning/clonezone
Supplerendstof:
Lone Als Egebo, Bioteknologi A, HTX, Udvikling af resistens: https://bioteknologia-htx1.ibog.nucleus.dk/?id=291
Lone Als Egebo, Bioteknologi A, HTX, Antibiotika smal og bredspektret: https://bioteknologia-htx1.ibog.nucleus.dk/?id=287
Lone Als Egebo, Bioteknologi A, HTX, Multiresistente bakterier: https://bioteknologia-htx1.ibog.nucleus.dk/?id=286
Lone Als Egebo: Mikrobiologi, Nukleus, Antibiotika og antibiotikas virkemåde: https://mikrobiologibogen.ibog.nucleus.dk/?id=199
Lene Bech Hansen, Claus Østergaard, Lene Bech Hansen, Claus Østergaard, Mikrobiologi, Munksgaard, Antibiotika: https://mikrobiologi-2udg.digi.munksgaard.dk/?id=232
Lene Bech Hansen et al, Munksgaard, Antibiotikaresistens: https://mikrobiologi-2udg.digi.munksgaard.dk/?id=233
Bioteknologi, HTX, Systime, Genregulering hos eukryoter: https://bioteknologi.systime.dk/?id=377
Tina Sølbek Schmidt, Anvendt bioteknologi, Nucleus, Det grønne flourescerende protein GFP: https://anvendtbioteknologi.ibog.nucleus.dk/?id=195
CRISPR-edited crops break new ground in Africa: https://www.nature.com/articles/d41586-024-00176-8?utm_source=Live+Audience&utm_campaign=12b8601fa3-briefing-wk-20240126&utm_medium=email&utm_term=0_b27a691814-12b8601fa3-49755792
CRISPR: Biotech academy dybde modul om CRISPR: https://www.biotechacademy.dk/undervisning/gymnasiale-projekter/crispr-cas9/crispr-cas9-leveringsmetoder/
Supplerendestof til forberedelse af øvelse til SRC:
Kvantifisering af bakterier og andre mikroorganismer.docx: https://www.lectio.dk/lectio/519/lc/63634562879/res/63634562880/Kvantifisering%20af%20bakterier%20og%20andre%20mikroorganismer.docx
1a-forsog-mikroorganismer-og-deres-anvendelsetilfermentering.pdf: https://www.lectio.dk/lectio/519/lc/63646307186/res/63646307187/1a-forsog-mikroorganismer-og-deres-anvendelsetilfermentering.pdf
Kapitel5_Oevelse-Maaling-af-vaekst-af-E-coli_v1.pdf: https://www.lectio.dk/lectio/519/lc/63646307186/res/63646307189/Kapitel5_Oevelse-Maaling-af-vaekst-af-E-coli_v1.pdf
Eksperiment_Dyrkning-og-vurdering-mikroorganismer-vækstmedie_Mikrobiologibogen (1).pdf : https://www.lectio.dk/lectio/519/lc/63646307186/res/63646307191/Eksperiment_Dyrkning-og-vurdering-mikroorganismer-v%C3%A6kstmedie_Mikrobiologibogen%20%281%29.pdf
Resistens Her er en fin video hvis nogen har brug for forklaringer den vej fra: https://www.youtube.com/watch?app=desktop&v=OaZ1X51AOwE
Videregådende læsning til SRC:
Jose M. Munita, Cesar A. Arias, Mechanisms of Antibiotic Resistance,
Microbiology Spectrum, Vol. 4, No. 2, 2016 : https://journals.asm.org/doi/10.1128/microbiolspec.vmbf-0016-2015
Supplerende Cellekloning:
Engelsk portal der omfatter Celle og genteknologi, Learn Genetics, Genetic Science learning Center University of Utah: https://learn.genetics.utah.edu/
Stamceller og Psykriatiske lidelser : https://www.med.uio.no/norment/forskning/aktuelt/aktuelle-saker/2022/stamceller-mekanismer.html
|